Ο Γιάννης Μαργαρίτης είναι Έλληνας σκηνοθέτης του θεάτρου, ίσως περισσότερο γνωστός για την παρουσίαση του έργου Ηλέκτρα.

Ο Μαργαρίτης είναι γιος της Νίκης Κυπραίου και του Άλκη Μαργαρίτη. Σήμερα είναι παντρεμένος με τη Χρυσάνθη Ντούζη και έχει μια κόρη τη Σεμέλη-Νίκη