Μετά από εφτά χρόνια θητείας στον πόλεμο Ινδίας και Γαλλίας, ο John Alden επιστρέφει στην πόλη του, το Salem της Μασαχουσέτης, θέλοντας να ξαναδεί τον έρωτά του, τη Mary.
Έχοντας πειστεί ότι οι μάγισσες είναι αληθινές αλλά νοιώθοντας έξω από τα νερά του, ο John Alden κάνει μια δύσκολη συμμαχία με τον κυνηγό μαγισσών Cotton Mather και, μαζί με τον Isaac, πηγαίνουν στο δάσος αναζητώντας απαντήσεις.
Ο δικαστής Hale μαθαίνει ότι ήταν ο Isaac εκείνος που είδε τη συγκέντρωση των μαγισσών στο δάσος και βάζει σκοπό να τον δικάσει, να τον καταδικάσει και να τον σκοτώσει ως μάγo, παρά τις αντιρρήσεις της Mary.
Όταν ο αιδεσιμότατος Lewis επιχειρεί έναν εξορκισμό στην κόρη του, Mercy, τα αποτελέσματα δημιουργούν προβλήματα στην κοινότητα και οι ηγετικές ικανότητες της Mary αμφισβητούνται.
Μετά την προειδοποίηση ότι η παρουσία του John Alden στο Salem αποτελεί σοβαρή απειλή για το Grand Rite, οι μάγισσες Hale και Rose συνεργάζονται και προσπαθούν να διώξουν τον Captain από την πόλη.
Για να μπορέσει να εντοπίσει ένα ισχυρό, μαγικό έργο τέχνης που ανήκει στον John Alden, η Mary εισχωρεί στον φανταστικό κόσμο του πρώην φίλου της. Όμως, τα συναισθήματα ανάμεσα στο ζευγάρι συνεχίζουν να υπάρχουν και έχουν επιπτώσεις στον πραγματικό κόσμο.
Καθώς ο Increase Mather περιμένει τον George Sibley να ξυπνήσει από το κώμα και να αναγνωρίσει τη μάγισσα που του έχει κάνει μάγια, η Mary χρειάζεται βοήθεια για να κρατήσει το στόμα του άντρα της κλειστό.
Η Mary χρησιμοποιεί όλες της τις δυνάμεις για να ελευθερώσει τον John Alden από τη φυλακή του Salem πριν ο Increase Mather τον περάσει από δίκη για μαγεία.
Καθώς η δίκη του John Alden για μαγεία ξεκινά, εκείνος αντιμετωπίζει μια κατηγορία που δεν μπορεί με τίποτα να αντικρούσει, κάνοντας ακόμα και τον πιο πιστό του σύμμαχο να αμφιβάλλει για την αθωότητά του.
Ενώ ο John και η Mary σχεδιάζουν να φύγουν μαζί από το Salem, κάποιοι στην πόλη συνεργάζονται για να αποτρέψουν τη διαφυγή τους, κάτι που οδηγεί σε μια αναπόφευκτη αναμέτρηση.