Ο ΜακΓκάιβερ καλείται να διασώσει μια ειδική ομάδα επιστημόνων, η οποία κινδυνεύει να εγκλωβιστεί μέσα στο μυστικό υπόγειο εργαστήρι που εργάζεται. Μια πρώτη ανεξήγητη έκρηξη έχει ήδη προηγηθεί και ο ΜακΓκάιβερ πρέπει μέσα σε ελάχιστο χρόνο να εμποδίσει την ολική καταστροφή και τη διαρροή τοξικών μέσα στο σύστημα δημόσιας ύδρευσης της χώρας…