Η Έρση Ξενάκη υπήρξε παντρεμένη με τον ηθοποιό Κωνσταντίνο Μαρκουλάκη με τον οποίο απέκτησαν έναν γιο, τον Γιώργο Ίκαρο.
Έπειτα στη ζωή της μπήκε ο Πέτρος Μπούτος με τον οποίο παντρεύτηκαν με πολιτικό γάμο το 2009.
Με τον δεύτερο σύζυγό της απέκτησαν δύο παιδάκια, ένα κορίτσι που ήρθε δύο μέρες μετά τον πολιτικό τους γάμο και ένα αγόρι, τον Απρίλιο του 2011.