Η ξυλοναυπηγική στο Αιγαίο είναι μια τέχνη που ασκείται σε νησιά που διαθέτουν πλούσια ξυλεία. Η Σάμος, με τα δάση της μαύρης πεύκης, ήταν ένα από αυτά κι γι' αυτό επιλέχθηκε για τη δημιουργία του Μουσείου Ναυπηγικής Τέχνης.